El Centro Nacional de Trasplantes dispone de diferentes programas para atender las necesidades de capacitación sobre donación y trasplantes de profesionales de la salud, estudiantes universitarios, miembros de organizaciones no gubernamentales y de grupos o instituciones interesados en el tema.

Para los profesionales de la salud, el Cenatra, ofrece el Diplomado universitario, para la formación de coordinadores hospitalarios de donación con fines de trasplante, con reconocimiento de la Facultad de Medicina de la Universidad Nacional Autónoma de México, destinado a personal médico, con el objetivo de profesionalizarlos en el desempeño de esta función.

El Taller del Sistema RNT y herramientas informáticas para la actividad de reporte, está dirigido a coordinadores de donación activos, para facilitar la comprensión y el dominio de las herramientas del sistema del Registro Nacional de Trasplantes, para informar, documentar y transparentar toda la actividad de donación y trasplantes que se realiza en las unidades hospitalarias.

Para estudiantes universitarios, miembros de organizaciones no gubernamentales y profesionales de salud interesados en contribuir a la tarea de fomentar la donación de órganos entre la población o los derechohabientes de los servicios de salud, el Cenatra ofrece el curso de Formación de líderes promotores de donación de órganos para trasplante orientado al conocimiento de la materia, al desarrollo de habilidades comunicación y de mecanismos de difusión del tema.

Para las instituciones o empresas, interesadas en informar sobre el tema de la donación al personal que integra sus equipos de trabajo, se otorgan conferencias y pláticas de orientación.